近日,中國水產(chǎn)科學院生物科技研究所在鯉抵御嗜水汽單胞菌感柒的分子結(jié)構(gòu)體制領(lǐng)域獲得重大進展,有關(guān)探討畢業(yè)論文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”發(fā)布于水產(chǎn)品類1區(qū)雜志期刊《Aquaculture》(2020年JCR1區(qū),IF=4.242)。該畢業(yè)論文獲得我國要點科研開發(fā)方案(2018YFD0900102)和中國水產(chǎn)科學院中央級服務(wù)性科研單位基本上科學研究業(yè)務(wù)費項目資金(2018B003和2020TD24)支助。江炎亮副研究員為論文的第一及通訊作者,許建研究者為一同通訊作者。文章內(nèi)容連接網(wǎng)站地址:https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.
嗜水汽單胞菌是鯉魚養(yǎng)殖中傷害最明顯的病原菌之一??茖W研究員工對傳染源和抵抗的鯽魚開展全基因重轉(zhuǎn)錄組測序并進行全基因相關(guān)性分析,精準定位到八個與抗病性特性明顯關(guān)系的SNP結(jié)構(gòu)域(圖1),并進一步尋找6個潛在性重要遺傳基因,均為免疫力有關(guān)遺傳基因:rab26,dcc,trim71,ptpn21,muc5b,trim25。八個明顯關(guān)系的SNP中,有一個為非同義詞SNP,坐落于遺傳基因trim25的外顯子地區(qū),可引起Trim25蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的更改(圖2),且該遺傳基因在經(jīng)嗜水汽單胞菌感柒后的鯽魚肝臟中明顯上漲表述??茖W研究結(jié)果顯示鯉在基因水準上的遺傳性差別影響了其抵御細菌感染的功能高低,為全基因培育鯉抗病性新品種給予了必不可少的分子結(jié)構(gòu)基本。
圖1. Manhattan 結(jié)果展現(xiàn)圖
圖2. Trim25 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預測分析
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