近日,蔬菜水果研究室在國(guó)際性生物學(xué)刊物Frontiers in Plant Science(IF=5.75)上刊登了名為“Identification of Quantitative Trait Loci Controlling the Development of Prickles in Eggplant forbid Genome Re-sequencing Analysis”的研究分析畢業(yè)論文。該探討對(duì)四季豆葉柄、葉子、葉莖和花萼上的刺開展了QTL精準(zhǔn)定位,對(duì)培養(yǎng)主莖沒刺的四季豆種類給予了理論基礎(chǔ)。
四季豆(Solanum melongena L.)是中國(guó)主要的茄豆類蔬菜蔬菜水果農(nóng)作物,近些年栽種總面積不斷發(fā)展,截止到2019年四季豆在我國(guó)的耕地面積達(dá)1,1七十萬(wàn)畝(FAO)。四季豆主莖莖、葉、花萼等位置均很有可能著生很多的刺,但刺特性不利整枝、采摘等農(nóng)牧業(yè)實(shí)際操作,針對(duì)四季豆農(nóng)業(yè)歸屬于不好特性,因而,進(jìn)行四季豆主莖刺特性有關(guān)的科學(xué)研究,針對(duì)培養(yǎng)沒刺的四季豆種類具備關(guān)鍵的實(shí)際意義。
本科學(xué)研究運(yùn)用了多刺的野外資源和少刺的種植自交系為父母搭建了一個(gè)F2四季豆基因遺傳人群,對(duì)四季豆葉柄、葉子、葉莖和花萼刺開展了科學(xué)研究。運(yùn)用搭建的6世世代代基因遺傳人群對(duì)這4個(gè)總數(shù)特性的基因遺傳開展了剖析。結(jié)果顯示四季豆葉柄、葉子、葉莖和花萼刺的最好基因遺傳實(shí)體模型各自合乎2 對(duì)主遺傳基因加性顯性基因上臺(tái)性實(shí)體模型,1 對(duì)負(fù)性完全顯性主遺傳基因[[ ]]加性顯性基因多遺傳基因?qū)嶓w模型,加性顯性基因上臺(tái)性多遺傳基因?qū)嶓w模型和2 對(duì)主遺傳基因加性顯性基因上臺(tái)性實(shí)體模型。
本分析對(duì)父母和一百個(gè)F2后代開展了重轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,各自在父母中得到了2,989,312和1,369,910個(gè)高品質(zhì)SNP標(biāo)識(shí)。運(yùn)用這種SNP標(biāo)識(shí)在四季豆的12個(gè)性染色體中搭建了帶有278,89一個(gè)Bin標(biāo)識(shí)的密度高的遺傳圖譜。運(yùn)用這一遺傳圖譜學(xué)者對(duì)四季豆莖、葉子、葉莖和花萼刺開展了QTL精準(zhǔn)定位,在其中莖刺在第三、4、5、6和8性染色體上精確定位到五個(gè)有關(guān)QTLs,葉子、葉莖和花萼刺各自在第9、1和12性染色體上各精準(zhǔn)定位到一個(gè)QTL。
根據(jù)QLT的精準(zhǔn)定位區(qū)段,學(xué)者找到2個(gè)WUSCHEL(WUS)有關(guān)遺傳基因SEML_012g394430和SEML_012g394440作為操縱四季豆花萼刺生長(zhǎng)發(fā)育的備選遺傳基因。學(xué)者較為了這兩個(gè)備選遺傳基因在父母中的差別,發(fā)覺SEML_012g394440遺傳基因在花萼沒刺的親本中有一段22bp的缺少,此缺少地區(qū)坐落于內(nèi)含子(18bp)和外顯子(4bp)中間,之上缺少很有可能造成 不一樣的拼湊方式從而造成花萼刺基因型的差別。進(jìn)一步r-PCR數(shù)據(jù)顯示在花萼有刺親本和F2后代中SEML_012g394440基因表達(dá)量明顯高過花萼沒刺親本和F2后代。之上科學(xué)研究為四季豆主莖刺有關(guān)特性的遺傳性和繁育給予了理論基礎(chǔ)。
北京農(nóng)林業(yè)研究院蔬菜水果所潛宗偉和張彬助理研究員為該畢業(yè)論文一同第一作者,崔彥玲營(yíng)銷推廣研究者和李大勇副研究員為一同通訊作者,該分析為北京農(nóng)林業(yè)研究院院青年基金課題研究科研成果,與此同時(shí)還獲得了我國(guó)要點(diǎn)科研開發(fā)方案、北京農(nóng)林業(yè)研究院高新科技自主創(chuàng)新能力基本建設(shè)重點(diǎn)的支助。
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